Легіони чудовиськ, відомих як Кайдзю, що піднялися з морських глибин, почалася війна, яка звела "людські ресурси" майже до нуля всього за декілька років. Щоб битися з прибульцями, було створено спеціальну зброю: величезні роботи, які управлялися одночасно двома пілотами, чиї свідомості сполучені за допомогою нейронного зв'язку. Але навіть гігантські машини виявляються майже безсилі перед лицем безжалісних Кайдзю.

На межі поразки у захисників людства немає вибору, окрім як звернутися до двох вельми сумнівних героїв — нікому не потрібному колишньому пілотові і недосвідченому стажистові —коториє об'єдналися, щоб повести в бій ніколи легендарного, але зараз застарілого Джегера. Разом вони виявляються єдиною надією людства, останньою перешкодою перед апокаліпсисом, що насувається.