Але є також істотні відмінності, особливо в генах, що відповідають за сексуальну поведінку, розвиток мозку, імунітет і нюх. Шимпанзе став четвертим ссавцем, гени якого повністю розшифрували вчені.
Частина наукового аналізу трьох мільйонів хімічних символів генетичного коду шимпанзе присвячена його дивній подібності до геному людини. Через 6 млн років незалежної еволюції різниця між шимпанзе і людиною вдесятеро більша, ніж різниця між двома людьми, що не перебувають у родинних зв’язках, і вдесятеро менша, ніж відмінності, що існують між пацюками і мишами.